سخن سردبیر
علیرضا ایرانبخش
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399
چکیده
طی چند سال اخیر، بحران قابلیت بازتولید (reproducibility crisis) به عنوان یک بحران مهم در مسائل زیستی مطرح شده است. بازتولیدپذیری به معنای شفاف و واضح بودن هر اقدام مرتبط با یک آزمایش است. بر اساس یک نظرسنجی که در سال ۲۰۱۶ در مجله Nature منتشر شد، نشان داده شد که محققین علوم زیستی با مشکلات زیادی برای بازتولید (Reproduce) آزمایشات مواجه هستند. این امر ...
بیشتر
طی چند سال اخیر، بحران قابلیت بازتولید (reproducibility crisis) به عنوان یک بحران مهم در مسائل زیستی مطرح شده است. بازتولیدپذیری به معنای شفاف و واضح بودن هر اقدام مرتبط با یک آزمایش است. بر اساس یک نظرسنجی که در سال ۲۰۱۶ در مجله Nature منتشر شد، نشان داده شد که محققین علوم زیستی با مشکلات زیادی برای بازتولید (Reproduce) آزمایشات مواجه هستند. این امر ممکن است به دلایل مختلفی از جمله تفاوت در الزامات مربوط به استانداردهای کیفی یک آزمایشگاه، مهارت کاربران مختلف، شرایط محیطی یک آزمایشگاه و … رخ دهد. به همین دلیل برای افزایش قابلیت بازتولیدپذیری در آزمایشگاهها، پروتکلهایی تعیین شده است. به کارگیری این پروتکلها به کاربران کمک می‌کند تا به دادههایی قابل مقایسه و تکرارپذیر دست یابند. این امر به ویژه در آزمایشگاههای کشت سلول اهمیت زیادی دارد. برای رسیدن به این هدف، باید همواره نکاتی را به خاطر داشت تا با بکارگیری آنها بازتولیدپذیری نتایج را افزایش داد. شناسایی دقیق سلول، به کاربردن پروتکل واحد برای انجام مراحل کشت سلول، بررسی روزانه کشت سلول و اطمینان از زنده ماندن سلول از نکاتی است که موجب افزایش باز تولیدپذیری نتایج می‌شود.
مقاله پژوهشی
کشت سلول و بافت 'گیاهی
نازیلا باقری؛ بهرام ملکی؛ علی عمارلو
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399، صفحه 1-5
چکیده
پیشینه مطالعه و هدف: گیاه مورد (Myrtus communis L.) گیاهی چندساله، معطر و با خواص دارویی متعدد می‌باشد. مورد یک گیاه دارویی است که در طب سنتی در بسیاری از نقاط جهان استفاده می‌شود. تکثیر این گیاه از طریق قلمه یا بذر دشوار است. دوره خواب طولانی بذر و تولید گیاهچه‌های کوچک و ضعیف از معایب دیگر تکثیر با بذر می‌باشد. بهینهسازی روشهای کشت بافت ...
بیشتر
پیشینه مطالعه و هدف: گیاه مورد (Myrtus communis L.) گیاهی چندساله، معطر و با خواص دارویی متعدد می‌باشد. مورد یک گیاه دارویی است که در طب سنتی در بسیاری از نقاط جهان استفاده می‌شود. تکثیر این گیاه از طریق قلمه یا بذر دشوار است. دوره خواب طولانی بذر و تولید گیاهچه‌های کوچک و ضعیف از معایب دیگر تکثیر با بذر می‌باشد. بهینهسازی روشهای کشت بافت به منظور آسان نمودن استفاده از ترکیبات این گیاه دارویی، بسیار مهم است. بنابراین در این پژوهش به بررسی اثر هورمون‌های مختلف باززایی بر افزایش راندمان باززایی این گیاه دارویی پرداخته شده است. روش مطالعه: برای اجرای این آزمایش نیاز به تعداد زیادی بذر جوانه‌ی زده‌ی این گیاه در محیط موراشیک-اسکوگ (MS) بود. بعد از 20 روز بذرهای جوانه زده به سه ریزنمونه‌ی ساقه‌چه، ریشه‌چه و برگچه تقسیم شده و در محیط MS حاوی هورمون 2,4-D تقسیم شدند. بعد از گذشت 7 روز در ریزنمونه‌ها کالوس‌زایی ایجاد شد. ریزنمونه‌ها برای ارزیابی درصد باززایی در محیط MS حاوی هورمون کنتین،BAP ، TDZ و ترکیب دو هورمون BAP+TDZ در چهار سطح (0-1-2-3) میلی‌گرم بر لیتر قرار داده شدند. نتایج: نتایج نشان داد که بیشترین میزان کالوس‌زایی و سرعت رشد کالوس در ریزنمونه‌های برگچه بدست می‌آید. هورمون کنتین کم اثرترین هورمون در جهت باززایی این گیاه بود و هورمون TDZ تاثیری بیشتر از دو هورمون کنتین و BAP بر باززایی داشت. همچنین بیشترین درصد باززایی کالوس در ریزنمونه برگچه در حضور 5/1 میلی‌گرم بر لیتر از هورمون BAP و 5/1 میلی‌گرم بر لیتر از هورمون TDZ مشاهده شد. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج بدست آمده از این مطالعه می‌توان نتیجه گرفت که استفاده از ریزنمونه برگچه و حضور هر دو هورمون TDZ و BAP میزان باززایی چشمگیری در گیاه مورد ایجاد می‌نماید.
مقاله کوتاه
ویروس شناسی و محیط های کشت ویروسی
آزاده حکمت
چکیده
انسان‌ها در طول سالیان طولانی همواره با ویروس‌ها درگیر بوده‌اند. عفونت‌های ویروسی موجب بروز عوارض شدید و حتی کشنده‌ای در انسان و حیوانات می‌شود. از آنجا که برخی ویروس‌ها خاصیت کشندگی بیشتری نسبت به دیگر ویروس‌ها دارند، بنابراین شناسایی سریع و درمان ویروس‌ها بسیار حائز اهمیت است. آپتامرها توالی‌های تک رشته‌ای سنتزی از جنسRNA ...
بیشتر
انسان‌ها در طول سالیان طولانی همواره با ویروس‌ها درگیر بوده‌اند. عفونت‌های ویروسی موجب بروز عوارض شدید و حتی کشنده‌ای در انسان و حیوانات می‌شود. از آنجا که برخی ویروس‌ها خاصیت کشندگی بیشتری نسبت به دیگر ویروس‌ها دارند، بنابراین شناسایی سریع و درمان ویروس‌ها بسیار حائز اهمیت است. آپتامرها توالی‌های تک رشته‌ای سنتزی از جنسRNA ، DNA یا پپتید هستند و با اختصاصیت بالا به مولکول هدف متصل میگردند. مزیتهایی ویژه آپتامرها باعث شده موثرتر از آنتی بادیها عمل نمایند. آپتامرها عموما از طریق فرآیند آزمایشگاهی Systematic Evolution of Ligands by Exponential enrichment (SELEX) از یک کتابخانه، غربال و انتخاب می‌شوند و میتوانند به مولکولهای هدف متصل شوند. در مقاله حاضر ابتدا به معرفی آپتامرها و سپس به بررسی کاربرد آنها در شناسایی سریع و درمان برخی ویروس‌های کشنده (ایدز، ابولا، آنفولانزا، پاپیلوما، سارس، مرس، آنفولانزا و کووید-19) پرداخته می‌شود.
مقاله پژوهشی
کشت سلول و بافت سرطانی
علی اصغر عزیزی جیرآبادی؛ سید عطا اله سادات شاندیز؛ مریم عباسی
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399، صفحه 15-20
چکیده
پیشینه مطالعه و هدف: سرطان سینه، یکی شایع‌ترین سرطان‌ها و دومین عامل مرگ و میر در زنان به شمار می‌رود. هدف از این مطالعه، بررسی اثرات ضد سرطانی عصاره سیانوباکتریPhormidiumm animale با کمک آزمون MTT و ارزیابی بیان ژنی p53 در رده سلولی سرطان سینه می باشد. روش مطالعه: در این مطالعه رده های سلولی سرطانی سینه (MCF-7) و نرمال (HEK293) تحت تیمار عصاره Phormidiumm ...
بیشتر
پیشینه مطالعه و هدف: سرطان سینه، یکی شایع‌ترین سرطان‌ها و دومین عامل مرگ و میر در زنان به شمار می‌رود. هدف از این مطالعه، بررسی اثرات ضد سرطانی عصاره سیانوباکتریPhormidiumm animale با کمک آزمون MTT و ارزیابی بیان ژنی p53 در رده سلولی سرطان سینه می باشد. روش مطالعه: در این مطالعه رده های سلولی سرطانی سینه (MCF-7) و نرمال (HEK293) تحت تیمار عصاره Phormidiumm animale با غلظتهای مختلف 50، 100 و 200 میلی گرم در میلیلیتر طی زمان 24 ساعت قرار گرفتند. درصد زنده مانی سلولها برروی ردههای سلولی با کمک روش رنگ سنجی MTT ارزیابی شد. بیان کمی ژن P53 نسبت به ژن کنترل GAPDH با کمک تکنیک Real-time PCR بررسی شد. نتایج: نتایج تست MTT نشان داد که عصاره P. animale، میزان زنده مانی سلولهای سرطانی را نسبت به سلولهای نرمال به طور معنی داری کاهش می دهد. همچنین، بیان ژن p53 بعد از تیمار با غلظتهای 50، 100 و 200 میلی گرم بر میلی لیتر عصاره P. animale به ترتیب 34/3 ، 15/5 و 11/9 برابر نسبت به ژن کنترل افزایش یافت. نتیجه گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که عصاره سیانوباکتری P. animale توانایی کشتن سلولهای سرطانی را دارد و این امر میتواند با کمک مرگ برنامه ریزی شده آپوپتوز با افزایش بیان ژن p53 در رده ی سلولی سرطانی سینه MCF-7 انجام گیرد.
مقاله پژوهشی
جلبک شناسی و محیط کشت جلبک
علی ناصری؛ مصطفی نوروزی
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399، صفحه 21-26
چکیده
پیشینه مطالعه و هدف: دیاتومه‌ها یکی از مهمترین شاخه‌های جلبک‌ها هستند و به دو گروه دیاتومه‌های دراز و دیاتومه‌های گرد طبقه‌بندی می‌شوند. رودخانه طالقان یکی از مهمترین سر شاخه‌های رودخانه سپیدرود ایران است که طولی معادل 180 کیلومتر دارد. این مطالعه مکمل مطالعات قبلی دیاتومیست‌ها در رودخانه طالقان و معرفی رکورد جدید از دیاتومه‌ها ...
بیشتر
پیشینه مطالعه و هدف: دیاتومه‌ها یکی از مهمترین شاخه‌های جلبک‌ها هستند و به دو گروه دیاتومه‌های دراز و دیاتومه‌های گرد طبقه‌بندی می‌شوند. رودخانه طالقان یکی از مهمترین سر شاخه‌های رودخانه سپیدرود ایران است که طولی معادل 180 کیلومتر دارد. این مطالعه مکمل مطالعات قبلی دیاتومیست‌ها در رودخانه طالقان و معرفی رکورد جدید از دیاتومه‌ها در این حوزه می‌باشد. روش مطالعه: این مطالعه از شهریور ماه 1398 تا شهریور 1399 و به طور فصلی از محل رسوبات دو ایستگاه بالا دست سد طالقان نمونه برداری شد. 60 میلی لیتر از رسوبات رودخانه به کمک سرنگی از عمق یک سانتی متری جمع آوری شد و در محلول فرمالین 4 درصد تثبیت شدند. از نمونه‌ها بر اساس دستور العمل استاندارد، اسلاید دائمی تهیه شد و با میکروسکوب نوری مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج: در طول نمونه برداری از دو ایستگاه بالادست سد طالقان گونه Pinnularia grunowii Krammer به عنوان یک رکورد جدید برای فلور دیاتومه های ایران شناسایی شد. از مهمترین خصوصیات این گونه داشتن طرح کلی والو سه موج، استریا بدون انحنا و سایز آن می‌باشد که آن را از سایر گونه‌های مشابه همانند Pinnularia subanglica Petersen ، Pinnularia biceps Gregory، Krammer Pinnularia lundii var. linearis وPinnularia angusta var. angusta (Cleve) Krammer متمایز می‌کند. نتیجه‌گیری: شناخت این گونه جدید در محیط طالقان ضرورت شناخت عوامل پراکنش و اکولوژیکی Pinnularia grunowii Krammer در سایر اکوسیستم‌های آبی ایران را آشکارتر می‌سازد.
مقاله پژوهشی
کشت سلول و بافت 'گیاهی
حسین پاسالاری؛ جواد کریمی
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399، صفحه 27-34
چکیده
پیشینه مطالعه و هدف: تراکم تراریزش کم و ظهور تنوع بالای سوما کلونال (soma clonal) از معایب کشت درون شیشه‌ای سیب‌زمینی (Solanum tuberosum L.) تلقی می‌شود. در این پژوهش، دو نوع هورمون گیاهیِ اکسین (NAA, 2, 4-D) و سیتوکینین (BAP, ZR) با غلظت‌هایی خاص بصورت ترکیبی برای دستیابی به یک پروتکل باززایی کارا برای سه ژنوتیپ سیب زمینی وتراز (Vetraz)، اسکارب (Scarb) و ادیسای ...
بیشتر
پیشینه مطالعه و هدف: تراکم تراریزش کم و ظهور تنوع بالای سوما کلونال (soma clonal) از معایب کشت درون شیشه‌ای سیب‌زمینی (Solanum tuberosum L.) تلقی می‌شود. در این پژوهش، دو نوع هورمون گیاهیِ اکسین (NAA, 2, 4-D) و سیتوکینین (BAP, ZR) با غلظت‌هایی خاص بصورت ترکیبی برای دستیابی به یک پروتکل باززایی کارا برای سه ژنوتیپ سیب زمینی وتراز (Vetraz)، اسکارب (Scarb) و ادیسای (Odyssey) استفاده شد. روش مطالعه: ریزنمونه‌ها بر روی محیط کشت MS با ترکیبات هورمونی 1 میلی‌گرم در لیتر BAP و 1/0 میلی‌گرم در لیتر NAA، 2 میلی‌گرم در لیتر BAP و 2/0 میلی‌گرم در لیتر NAA و 3 میلی‌گرم در لیتر BAP و 3/0 میلی‌گرم در لیتر 2.4-D، 1 میلی‌گرم در لیتر ZR و 1/0 میلی‌گرم در لیتر NAA، 2 میلی‌گرم در لیتر BAP و 2/0 میلی‌گرم در لیتر NAA و 3 میلی‌گرم در لیتر BAP و 3/0 میلی‌گرم در لیتر NAA قرار داده شد. نتایج: بیشترین درصد و تعداد ریشهزایی و باززایی شاخساره در محیط حاوی 3/0 میلی‌گرم در لیترNAA و 2.4-D و 3 میلی‌گرم در لیتر BAP و ZR به ترتیب، رخ داد. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج بدست آمده از این مطالعه سه ژنوتیپ سیب زمینی از لحاظ آماری در ظرفیت باززایی برگهایشان متفاوت بودند. ژنوتیپ ادیسای (Odyssey) پاسخ ضعیفی به باززایی برگ نشان داد.
مقاله پژوهشی
ژنتیک پزشکی
Saeed Zaker Bostanabad؛ Soheila Darmanlo؛ Somayeh Darmanlo
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399، صفحه 35-40
شناسنامه علمی شماره
دوره 1، شماره 2 ، آذر 1399
